
2023年4月2日,西班牙科尔多瓦大学Tomas Cerdo等人在Cell Host & Microbe(IF=30.3, 2023)杂志发表了题为“Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice”的文章。研究人员使用16S rRNA测序、宏球蛋白质含量组学和基础代谢组学分享揭示了婴儿认识和肠道菌群之间的联系。结果显示认识能力较好的婴儿肠道菌群可以增强小鼠的记忆,并调节了小鼠外周血皮层(PRC)的组氨酸代谢组,这些结果表明“肠脑轴”在婴儿时期就起到至关重要的作用。
因为宝贝标题:Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice (Cell Host & Microbe,IF=30.3, 2023)
简体中文题头:婴儿肠道微生物群有助于小鼠的认知表现
组学技术工艺:16S rRNA+宏蛋白质组学+代谢组学
样本量信心:婴儿粪便、小鼠粪便
调查思绪
(图源:Tomas Cerdo, et al., Cell Host & Microbe. 2023)
注意探究毕竟
01、婴幼儿了解效果和肠腔菌群结构类型的联系
首先,研究人员基于贝利婴儿发育量表(BSID-III)数据,根据6个月大的婴儿在复合认识、语言和运动三个领域的得分,将婴儿分为高于中位数组和低于中位数组。通过对婴儿粪便样本进行16S rRNA分析,发现唯一与肠道微生物群落结构密切相关的BSID-III量表是复合认识(CC)。 与不低于CC中数字组(Inf-belowCC)的幼儿相较于,低于CC中数字组(Inf-aboveCC)的幼儿肠子菌群有更高的的均匀分布性( 图1A)。在属水平上,Inf-aboveCC组的肠道菌群中杆菌、链球菌、拟副杆菌、严格感梭菌、霍氏杆菌和瘤胃球菌富集,而无毛螺科、嗜血杆菌和乳球菌的显著减少(图1B-D)。上述结果表明, 正确认识业务能力各种不同的新生宝宝,其肠管分子生物学工程在群落格局表现上都存在有效一定的差异 。
图1. Inf-aboveCC和Inf-belowCC组新生儿消化道菌群聊成空间结构
02、产品意识效果想关的宏蛋清质组功能
为了探究与婴儿认识相关的肠道菌群功能特征,研究人员采用宏蛋白质组学对婴儿粪便进行分析。结果表明,Inf-belowCC组的肠道菌群富含参与细胞内运输分泌和囊泡运输的蛋白质,而Inf-aboveCC组中参与碳水化合物运输和代谢的蛋白质有增加的趋势。稀疏偏最小二乘判别分析(sPLS-DA)图显示,婴儿宏蛋白质组(图2A)和促进区分的已鉴定蛋白质组(图2B)之间存在明显区别。组氨酸酶(HutH)是Inf-aboveCC宏白质组中拥有相关系数丰度的血清质。随后,研究人员通过DESEq2差异丰度分析(图2C)和Wilcoxon检验进一步证实了上述结果,组氨酸分解代谢的两种下游酶尿糖酸脱水酶(HutU)和咪唑酮丙酸酶(HutI)在Inf-above CC宏蛋白质组中丰度较高。上述分析结果揭示了与婴儿认识能力相关的宏蛋白质组特征。
图2. 宏球膳食纤维组学生物富集解析
03、组氨酸新陈代谢与新生婴儿认知工作能力工作能力相关
宏蛋白质组学数据和生化实验结果表明婴儿组氨酸代谢与认识能力相关,因此,研究人员开发一种靶向药物新陈代谢组学方法用于定量分析组氨酸代谢物水平(图3A)。结果表明Inf-aboveCC组婴儿粪便中的尿酸盐水平显著降低,而其余组氨酸代谢物则无差异(图3B)。研究人员进一步检测了婴儿尿液中的组氨酸代谢物,结果显示与Inf-belowCC相比,Inf-aboveCC组婴儿尿液中组胺、组氨酸和尿酸水平显著升高(图3C),且Inf-aboveCC组粪便中的尿酸盐/组氨酸比值(图3D)和尿液中的组胺/尿酸盐比值(图3E)显著降低。粪便中的尿酸盐/组氨酸比值与unclass_lachnospirace_41和Lachnospiraceae incertae sedis属呈负相关,与Bacteroides_3呈正相关(图3F)。尿液中的组氨酸水平与Streptococcus_42和Bacteroides属呈正相关,而尿酸水平与Holdemanella_16呈负相关,与链球菌属呈正相关(图3G)。
图3. 组氨酸代谢率与产品看法力相关联
04、宝贝供体的肠胃菌群小鼠迁移
最后,为了调查肠道微生物群是否有助于认知,研究人员进行了一项粪便微生物群移植(FMT)实验。结果表明,将Inf-aboveCC供体的粪便移植到GF小鼠体内,其记忆功能优于Inf-belowCC供体的小鼠(图4)。被婴儿肠道菌群定植的小鼠拥有与记忆功能相关的不同细菌分类群,认知表现较好的婴儿微生物群小鼠表现出更高的记忆功能,包括Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium物种在内的丰富分类群以及不同的组氨酸代谢组学特征(图4B),其中,毛缕菌科和拟杆菌类与婴儿认知的关联在人源化小鼠中得到了复制。此外,与接受Inf-belowCC肠道微生物组的小鼠相比,确认Inf-below cc肠管益生菌制品组的小鼠HutH可溶性恰恰比较高。总之,这些结果表明通过婴儿供体的肠道菌群粪便移植的记忆功能可以传播给GF小鼠,表明肠道菌群可以作为一种促进记忆的实体。
图4. 被婴幼儿可以使肠胃菌群定植的小鼠都有与记忆里的功能关联的各种菌几大类群
总结
笔者认为,设计成员按照16S rRNA测序、宏蛋清质组学和新陈新陈产生组学探讨确立了小宝宝组氨酸新陈新陈产生组与自我社会判断的水平互相的沟通,消息队列现一个多个与知道技能相关的英文于系的新陈新陈产生酶—组氨酸酶(HutH)。HutH关卡的之間的关系及其他的粪液和排尿组氨酸新陈新陈产生组与小宝宝自我社会判断的水平相关的英文于。因此,按照小宝宝供体的直肠菌群粪液冻胚种植的记性技能也可以网络传播给无菌操作小鼠,知道技能好些的小宝宝供体冻胚种植小鼠丰富Phocaeicola, Bacteroides和Bifidobacterium等与自我社会判断的水平技能相关的英文于的革兰氏阴性菌。设计显示小宝宝分手后复合自我社会判断的水平和直肠菌微博黑名单成互相的关系最初在6个月时间时就确立在一起了,组氨酸新陈新陈产生物关卡的缓解是一种种因素的管理机制。拜谱个人总结
本研究通过16S rRNA测序和宏淀粉酶质组学分析使组氨酸酶在婴儿认识中的作用脱颖而出,并通过代谢组学和粪便移植的方法进一步验证,全部阐释了在宝贝-排泄物试管移植小鼠管理体系中肠胃菌群对的了解效果的影响到,为“肠脑轴”在宝贝十六国时期的的发展和反应考核机制出示了新的正确理解。拜谱生物作为一家国内领先的多组学服务公司,可提供蛋白质组学、代谢组学、修饰组学、16S rRNA测序等多组学技术,结合组学技术拜谱生物也推出了针对不同样本和研究领域的多组学研究方案,包括肠道篇、血液篇、医学篇等,帮助客户解决研究难题,助力多篇高分文章的发表,欢迎大家咨询!
参看文献:Tomas C, Alicia RR, Inmaculada A, et al. Infant gut microbiota contributes to cognitive performance in mice. Cell Host & Microbe. 2023, 31(12): 1974-1988. doi: 10.1016/j.chom.2023.11.004.