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拜谱新品发布| 免疫肽组,基于质谱的新生抗原鉴定与筛选

发布时间:2024-09-26
T上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核能设别肺部肿瘤上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核面上的关键团体相融性软型体(MHC)呈递的抗原而触及免役性体现。MHC I类(MHC-I)分子式式结构与CD8+ T上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核彼此意义,其呈递的肽关键来原于内源性胞质淀粉酶的淀粉酶酶体溶解塑料,而MHC II类(MHC-II)分子式式结构关键表答于靠谱抗原提呈上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核,与CD4+ T上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核彼此意义,其呈递的肽根据并能内体条件溶解塑料的胞外和胞内淀粉酶(图1)。但是,设别由MHC分子式式结构呈递的肺部肿瘤抗原面对的设计依赖感T上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核设别和杀掉肺部肿瘤上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核的效果和营养健康的肺部肿瘤免役性方法是至关关键的。基本概念质谱(MS)的免役性肽组学(Immunopeptidomics)能从种上皮淋巴癌肿受损人体受损受损神经细胞核系、肺部肿瘤团体和营养健康团体中mtk量、可以签别MHC根据肽。

拜谱生物全新推出免疫肽组拜谱生物,通过MHC表面抗原含有MHC名词解释整合肽,使用Orbitrap Astral全新一代高分辨质谱仪检测,直接得到免疫性肽字段和全文翻译后修饰语内容,提高基因测序的真实度,并采用De novo从头到尾测序技木,不依赖现有数据库,更加高通量鉴定出MHC上呈递的多肽,发现更多非典型免疫肽,而且多种的资料分析一下的内容为医学研究中的新抗原鉴定、免疫治疗和疫苗开发提供支持。欢迎大家咨询!

图1 MHC-I和MHC-II呈递淋巴肿瘤抗原的方法

(图源:Xie et al.Signal Transduction Targeted Ther. 2023)

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成功案例探讨

01 新机制调查

好的文章提题:The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells

发布月刊:Science Advances IF:11.7 2024

XPO1 (Exportin-1/CRM1)都是种核内容输出淀粉酶,在肿癌中一般过表现,并且做好为肿癌突发的驱使问题。近些年,靶点XPO1的小原子核正被代替药学抗肿瘤性药物。

作者发现XPO1是自然杀伤(NK)细胞的靶标。利用免疫抗体肽组学,作者鉴定出一种衍生自XPO1的肽,它可以在人类白细胞抗原- C的背景下被激活的NK细胞受体KIR2DS2识别。该肽可以内源性加工并通过该受体特异性地激活NK细胞。虽然XPO1在癌症中的高表达通常与不良预后相关,但研究发现,如果有NK细胞浸润的证据,特异性癌症(如肝细胞癌)的预后可以大大改善。因此,作者确定XPO1是NK细胞识别的真正的肿瘤抗原,为NK细胞治疗实体瘤的个性化方法提供了机会。

图2 另外一种来源于XPO1的肽是KIR2DS2的配体

(图源:Blunt, Matthew D et al.,Sci Adv. 2024)

02 肿癌-免疫性中药治疗

本文题:Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors

发表文章报刊:Nature Communications IF:16.6 2023

恶性瘤胸膜间皮瘤(MPM)是一个个种生存率不良的的侵入性肿癌。在现存的中药诊治实施方案缺失药用价值,因而迫在眉睫要新的中药诊治方法。由于其T神经细胞浸润性,我们选用MPM是一个个个刚好合适的中药诊治性肿瘤预防针的目标值。

迄今为止,对间皮瘤的研究一直集中在识别分子标记以更好地对该疾病进行分类和表征,对涉及细胞毒性(CD8+) T细胞的治疗靶点知之甚少。在这项研究中,作者利用为质谱的免役肽组研究了小鼠(AB12细胞系)和人细胞系(H28、MSTO-211H、H2452和JL1)以及患者原发性肿瘤中MPM的抗原呈递景观。作者使用来自人类健康供体和癌症患者的T细胞体外表征了洗脱肽的免疫原性特征。此外,作者选择最有前景的肽搭配PeptiCRAd方法,在雌性小鼠的间皮瘤小鼠模型中测试其疗效。总的来说,作者证明了免疫肽组学分析与溶瘤免疫疗法相结合的使用代表了一种解决不可治疗肿瘤的可行且有效的策略。

图3 恶劣胸膜间皮瘤免疫抗体肽组学在线检测

(图源:Chiaro, Jacopo et al.,Nat Commun. 2023)

03 微生物mRNA预苗开发技术

文章内容题型:Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes

发表论文期刊杂志:Nature Communications IF:16.6 2023

单核细胞增生李斯特菌是一种导致人类李斯特菌病的食源性细胞内细菌病原体。尽管死亡率高且抗生素耐药性增加,但仍没有临床批准的针对李斯特菌的疫苗可用。为了鉴定新的抗原,作者通过基本概念质谱的免疫细胞肽组学来筛选呈现在受感染的人类细胞系表面的李斯特菌肽。在超过15000种人类自身肽中,作者检测到来自42种不同细菌蛋白的68种李斯特菌免疫肽,包括几种已知抗原。呈现在不同细胞系上的肽通常来自相同的细菌表面蛋白,将这些抗原归类为潜在的候选疫苗。在脂质纳米粒mRNA疫苗制剂中编码这些高度呈递的抗原导致特异性CD8+ T细胞应答,并在小鼠的疫苗接种攻击实验中诱导保护。研究结果可以作为开发针对李斯特菌的临床mRNA疫苗的起点,证明了基于质谱的免疫肽组学在下一代细菌疫苗开发中的作用。

图4 在李斯特菌沾染的Hela组织和HCT-116组织中监定MHC I呈递的抗原肽。

(图源:Mayer, Rupert L et al.,Nat Commun. 2022)

拜谱个人心得体会

抗体性装置肽组学是血清酶质组学的同一个很快成长的旁支,它潜心于探究抗体性装置装置中由主要组识相匹配性结合体(MHC)或人类白人体神经内部系核抗原(HLA)分子式呈递的抗体性装置肽。等等抗体性装置肽是人体神经内部系核外面呈递的肽段,也能被T人体神经内部系核设别,可以闪避抗体性装置不良反应。基本概念质谱的抗体性装置肽组学以经是认定MHC血清酶呈递肽的金标准技巧,也能同时认定有所有所不同生理问题和病症阶段下有所有所不同组识和人体神经内部系核型中的抗体性装置肽组,假如小平面瘤或艾滋病毒患上的人体神经内部系核。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,可提供完善成熟的淀粉酶组学、排泄组学、转录组学等多组学产品技术服务体系。全新推出的免疫力肽组探测贴心服务,通过MHC抗体特异性富集,高分辨质谱检测结合De novo从头测序技术,够准确的且马上作为免疫系统细胞肽队列,感觉越多非主要免疫系统细胞肽,逐渐需求出能信新抗原,有助于医学研究人员理解免疫系统的机制、开发疫苗、个性化癌症免疫疗法以及深入了解各种疾病的发病机制。

对比文献资料

1. Xie N,Shen G,Gao W, et al. Neoantigens: promising targets for cancer therapy. Signal Transduct Target Ther. 2023;8 (1):9. doi:10.1038/s41392-022-01270-x 2. Blunt MD,Fisher H,Schittenhelm RB, et al. The nuclear export protein XPO1 provides a peptide ligand for natural killer cells. Sci Adv. 2024;10 (34):eado6566. doi:10.1126/sciadv.ado6566 3. Chiaro J,Antignani G,Feola S, et al. Development of mesothelioma-specific oncolytic immunotherapy enabled by immunopeptidomics of murine and human mesothelioma tumors. Nat Commun. 2023;14 (1):7056. doi:10.1038/s41467-023-42668-7 4. Mayer RL,Verbeke R,Asselman C, et al. Immunopeptidomics-based design of mRNA vaccine formulations against Listeria monocytogenes. Nat Commun. 2022;13 (1):6075. doi:10.1038/s41467-022-33721-y
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