草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿程序通多见的肠腔疾病中的一种。肾组建中CaOx晶胞过饱和沉淀积累会造成肾小管组织细胞挫裂伤和凋亡，最后造成肾结石的生成。短链皮下人体脂肪酸由肠腔内活性污泥沙门氏菌沤肥饮食营养合成纤维诞生，除了在位置肠腔天然屏障中推动做用，况且在程序质量上也推动关键所在做用。这其中，丁酸是最非常丰富的短链皮下人体脂肪酸，具备消除炎症和天然免疫压制做用,本科研研讨丁酸对CaOx肾结石的做用简答隐藏的靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山三甲医院泌尿产科吴忠专家教授、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教受、周子健博士研究生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物学与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网络上药学学功能，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

软文称谓：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 顾客工作单位：华山机构 深入分析群体：大鼠、HK-2肿瘤细胞 好友分组资料：比对组（Con）、实体模型组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱出具的技术：网格药剂学学探测

指导思想具体步骤图

钻研导致

科研员前提是融合大鼠3d沙盘模型工具，在女性生理生化学评价指标和组识病症学刺绣等科研方式方法感觉丁酸会以减少CaOx3d沙盘模型工具大鼠肾CaOx尖晶石的成型和磨损，纠正CaOx3d沙盘模型工具大鼠的疾病磨损和阳极阳极氧化成分的过渡表达出来。不但，丁酸还可限制草酸引诱的HK-2上皮体细胞磨损、阳极阳极氧化应激性和上皮体细胞凋亡。 为研究分折丁酸框架和靶表观遗传组遗传wifi网路，研究分折人群从PubChem提取丁酸和丁酸酯的二维和二维框架（图1A）。借助PharmMapper的的数据表格表和Uniprot的的数据表格表加工处理后共需求出11七个丁酸靶表观遗传组遗传供进一个步骤分折。将表观遗传组遗传的数据库文件拷贝到STRING的的数据表格表，通过PPIwifi网路分折。Cytoscape如下了编排的前20的联络线站靶表观遗传组遗传的详情wifi网路图，分为CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这样联络线站表观遗传组遗传与wifi网路中的另外表观遗传组遗传均表演出需的涉及到的性，阐述这样表观遗传组遗传几率性充分充分发挥着协同工作做用。GO和KEGG分折折射出了丁酸联络线站表观遗传组遗传的涉及到的途经和生态学学功用（图1C）。联络线站表观遗传组遗传重点与类固醇生长伤害性素对答、空气氧化发应应激状态状态对答、渗透性酶氧体细胞对类固醇生长伤害性素伤害性的发应及对偏酸电学材料的发应有关系。上述情况指出，这样联络线站表观遗传组遗传重点参于了空气氧化发应应激状态状态和对渗透性酶氧的生态学发应全过程，是肾结石生成制度化中至关极为为重要的途经，这发现丁酸几率性在肾结石中充分充分发挥极为为重要做用。

图1| 丁酸构成与靶人类基因在线了解(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为更加骤探究丁酸对CaOx肾结石这些切靶遗传表观遗传组，探析人群回收利用GEO数据表格表格库对GSE73680中健康保健剖析与CaOx肾结石病人的遗传表观遗传组共同决定使用了探析。剖析组与CaOx结石病人的关联系数性共同决定表示爱爱遗传表观遗传组（DEGs）选择标准单位为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共选择到3783个遗传表观遗传组有关联系数变迁，里面3379个（89.4%）遗传表观遗传组表示爱爱调涨，404个（10.6%）遗传表观遗传组表示爱爱下降（图2A）。对DEGs使用聚类分析法具体分析法具体分析，热图现示了前10个被选中DEGs的二维分出层次聚类分析法具体分析法表现形式（图2B）。随后不久，探析人群经过GeneCards数据表格表格库人工费检测了370个能够与CaOx肾结石关联的遗传表观遗传组，排名榜前20位的分析遗传表观遗传组简述关联性评估如2C一样。方便找见丁酸调理CaOx肾结石的至关重要靶点，探析人群将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关联遗传表观遗传组处理能够 好几个个Venn图。后面，CYP2C9被确保为丁酸决定CaOx肾结石的内在的靶点(图2D)。于此，探析人群还使用了丁酸与CYP2C9的大分子项目对接，CYP2C9的三种氨基残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸共同的功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在使用在线药学学精准预测CYP2C9是丁酸应响CaOx肾结石的靶基因遗传后，探析人还实现人体癌细胞实验性验证了CYP2C9可降草酸帮助的HK-2人体癌细胞的ROS水平方向、宫颈炎症受损和凋亡。

图2| 很多据库联合技术研究分析估计CYP2C9是丁酸的作用于CaOx肾结石的靶基因组

科学研究后果

本理论研究第一步感觉丁酸在休外和肚子里均能限制CaOx肾结石绘图的阳极硫化应激性反应和慢性宫颈发炎受损，继而能够网信息临床临床药理学挑选取得丁酸干扰CaOx肾结石的潜在的靶点——CYP2C9，最后的能够血癌细胞實驗验证CYP2C9在草酸盐诱骗的HK-2血癌细胞ROS系统水平、慢性宫颈发炎受损和凋亡。此类感觉证明丁酸也许 能够限制CYP2C9来限制CaOx肾结石的阳极硫化应激性反应，消除慢性宫颈发炎受损。这样整个过程中拜谱怪物体供应了网信息临床临床药理学系统安全服务性，前者拜谱怪物体可上升稳定改进的基因组组学、蛋清质组学、代谢率组学等多个学產品及系统安全服务性，感谢拨打电话咨询了解！ 参阅论文资料：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.