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Microb Cell Fact | 遵义医科大学冯昆团队揭示无柄灵芝培养物产生灵芝酸的机制

发布时间：2024-07-25

三萜类化合物已现示出诸多的生物制品吸附性，涉及抗肺部肿瘤和抵抗毒效果。往往，三萜是确认甲羟戊酸经过人工的，并从大自然仿真植物和病菌中领取。遵义医科大学冯昆团队在Microb Cell Fact（IF=6.4）上发表过了名为“Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile”的学习论文范文。该学习显示三萜类有机化合物虫草粉酸（GA）是进行流体训练的无柄虫草粉菌丝体中二萜15,16-二氢丹参酮I（DHT）的生物技术学和转化了呈现的。可以通过转录组和淀粉酶质组学技艺进这一步生命的进化无柄野生灵芝粉菌丝体中DHT呈现俩种野生灵芝粉酸（GA）的制度，并会根据多个学技艺的检测到的差距DNA和差距淀粉酶，预测未来DHT 生物技术学合并 GA 的经过。拜谱生物提供了转录组测序和TMT定量蛋白质组学技术，为研究二萜生物转化为三萜提供了丰富的组学信息和候选基因。

文章名称：Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile（Microb Cell Fact，IF=6.4，2023.7）

客户单位：遵义医科大学

研究材料：无柄灵芝真菌菌丝体

拜谱提供技术：转录组测序、TMT定量蛋白质组学

研究结果

1.转录混合物析和系统种类

用对无柄野生灵芝白色念珠菌菌丝体完成转录组测序共取得67230个转录本和1429八个单染色体。在这单染色体中，495个被鉴定会为性别差异表明染色体（DEGs），表中213个表明上涨，279个表明再降（图1A）。GO生物工程生物聚集定量剖析后，DEGs可分成生物工程工作（BP）、内部组成（CC）和原子功用（MF）3类。在BP行业类型中，造成了前多个子行业类型：抗菌药溶解产生工作，乙酸盐产生工作和甲酸盐产生工作;而在CC行业类型中，内部外区、突触复合材料体、突触设计是前多个亚类。针对MF行业类型，甲酸脱氢酶（NAD）亲水性、防氧化备份酶亲水性和酸氨（或酰胺）接酶亲水性是前多个亚行业类型（图1B）。在DEGs的KEGG卫星信号环路定量剖析中，前30条生物工程生物聚集度至高的卫星信号环路有27条是指产生，表中丁烷产生、乙醛酸盐和二羧酸盐产生、丙酸盐产生卫星信号卫星信号环路相关性生物工程生物聚集（图1D）。

图1|转录混合物析和功能键分类别

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

2. 蛋白质组定量分析和功能分类

根据对无柄虫草真菌孢子菌丝体来进行核蛋清酶质组学讲解，共有选择了16,457种奇特肽、2606种核蛋清酶质和2588种定量介绍核蛋清酶质。在域值|FC|>1.2和p<0.05的需求状况下，你在2606种核蛋清酶质中，94种被鉴定费为对比介绍展示方式核蛋清酶（DEPs），之中52种调涨，42种再降（图2A），图2C界面体现信息了对比介绍展示方式核蛋清酶的聚类算法讲解热图。从GO讲解方面看，BP门类界面体现信息，基本上都数DEPs进行冰醋酸盐转换的产生流程、消炎药转换的转换的产生流程和药物治疗转换的转换的产生流程。CC类DEPs在体细胞核系系外区、过被金属氧化反应物酶体和微体中总量极限，被氧化反应完美重现酶灵催化活性和甲酸脱氢酶（NAD）灵催化活性在MF类中DEPs的比倒极限（图2B）。与转录组信息相似性，KEGG通道讲解界面体现信息，越来越多DEPs在转换的产生中丰度，之中3条最丰度的方式是光合生物学体中的碳紧固、碳转换的产生和MAPK无线信号通道（图2D）。另外，根据讲解GO信息库的CC对DEPs来进行亚体细胞核系系定位系统讲解和注脚（图2E），DEPs最主要的的区域在体细胞核系系质（40.66%）、体细胞核系系膜（17.58%）、线粒体（12.09%）和内质网（8.79%），说法上是GAs生物学体聚合的最主要的的定位。

图2|球蛋白组的参考值介绍和功效核实

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

3.转录组和蛋白质组数据相关性分析，RT-qPCR验证

为食物转变和比组获选DEGs和DEPs加工制作了维恩图，有20个差别的表明人类dna组（图3A）。对转录组和蛋清质组中E组和C组共计的DEGs/DEPs来进行聚类概述概述，出现 mRNA和蛋清质范围内有19个调涨人类dna组和9个调整人类dna组，DEGs和其翻意的DEPs表明层次呈正有关系，依托于Pearson的有关系比率概述，在转录组和蛋清质组范围内在线检测到相应较高的有关系性（R = 0.87）（图3C）。实时荧光定量PCR（RT-qPCR）论文检测最终的结果表现，E组和C组11个大概DEGs的传达方式技术差别显著性，这当中9个为上浮DEGs，俩为上涨DEGs（图3D）。DEGs在RT-qPCR中的传达方式潮流与转录类物质析最终的结果同样。

图3|球膳食纤维组的降钙素原检测定量分析和用途证实

(图源：Wang X., et al., Microb Cell Fact., 2023)

拜谱小结

综上所述，该研究结果为真菌对天然产物的生物转化提供了新的见解，这将有助于开发更有效、更经济的方法，以方便的方式获得稀有的三萜。拜谱生物提供了转录组测序、TMT定量蛋白质组学转录组学技术，拜谱生物可提供完善成熟的转录组学、蛋白组学、代谢组学以及多组学联合产品技术服务体系。此外，拜谱生物推出的中药代谢组整体解决方案，基于更丰富、更专业的中药数据库，更高的数据质量、更优质的服务，可进行中药成分分析、中药入血/组织分析、网络药理学等分析，助力客户探索中药前言研究，欢迎致电咨询！

参考文献：Wang X, Wu H, Wong KH, Wang Y, Chen B, Feng K. Biotransformation of triterpenoid ganoderic acids from exogenous diterpene dihydrotanshinone I in the cultures of Ganoderma sessile. Microb Cell Fact. 2023 Jul 28;22(1):139. doi: 10.1186/s12934-023-02156-5.

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